
Asamblea General
Es la máxima autoridad y está conformada de la siguiente manera:
Presidente
Mtro. Miguel Angel Hernández Espejel
Titular de la Secretaría de Educación, Ciencia, Tecnología e Innovación del Gobierno del Estado de México
Integrantes
* Dr. Ricardo Villanueva Lomelí
Subsecretario de Educación Superior de la Secretaría de Educación Pública
* Dra. Silvia Elena Giorguli Saucedo
Presidenta de El Colegio de México
* Dr. Carlos Eduardo Barrera Díaz
Rector de la Universidad Autónoma del Estado de México
* Lic. Ricardo Moreno Bastida
Presidente Municipal Constitucional de Toluca
* Lic. Manuel Vilchis Viveros
Presidente Municipal Constitucional de Zinacantepec
* Dr. Raymundo César Martínez García
Presidente de El Colegio Mexiquense, A.C.

Junta de Gobierno
Tiene a su cargo la ejecución de los actos de toda naturaleza que lleven a la consecución del objeto social de El Colegio, a la observancia de su normatividad y al cumplimiento de los acuerdos y disposiciones que emita la Asamblea General. Son miembros de la misma:
- Dr. Raymundo César Martínez García.
Presidente de El Colegio y de la Junta
- Dra. María del Carmen Salinas Sandoval
- Dra. Karen Kovacs Strumpfner
- Dra. Gloria del Castillo Alemán
- Dr. Carlos Alfonso Ledesma Ibarra
- Dra. Ana Lau Jaiven